入驻京东保健品自营店的流程大致可以分为以下几个步骤：

1. 提交申请

商家首先需要登录京东商家中心，在入驻申请页面填写相关信息，并提交申请。

2. 审核资质

京东平台会对企业的相关资质进行审核，包括企业营业执照、组织机构代码证和税务登记证等。

3. 缴纳保证金和年费

商家需要支付一定的保证金，一般在2-15万元人民币之间。此外，还需要支付每月1000元的平台使用费。

4. 签订合同

审核通过后，商家与京东签订合作协议。

5. 上架商品

zui后，商家根据平台要求上传商品信息和图片，正式开始销售。

需要注意的是，以上流程可能会因地区和具体情况而有所不同。如果商家对这些流程不熟悉或者遇到困难，也可以寻找zhuan业人士提供帮助。

此外，商家需要具备合法的营业执照、组织机构代码证和税务登记证等相关证件，以及品牌方的授权书，确保所售商品均为zheng品，并具有一定的品牌影响力。商家所售商品需要符合国家相关质量标准，且具有良好的售后保障服务。

以上信息仅供参考，具体的入驻要求可能会因地区和具体情况而有所不同。如果商家对这些流程不熟悉或者遇到困难，也可以寻找zhuan业人士提供帮助。