京东保证金退还的流程通常包括以下几个步骤：

申请退款：商家需要在店铺关闭或解除合作关系时，向京东提交保证金退还申请。申请可以通过京东商家后台进行，也可以通过联系京东客服来进行。

提交材料：商家需要提供相关的材料和信息，比如店铺信息、银行账户信息等。这些信息必须准确无误，以避免退款过程中的延误或错误。

审核流程：京东会对商家的申请进行审核，审核时间一般为3-5个工作日，具体时间根据实际情况而定。

保证金退还：审核通过后，京东会将保证金退还到商家的银行账户中。需要注意的是，退还的保证金金额可能会扣除一定的手续费，具体金额根据实际情况而定。

请注意，商家在经营过程中需要遵守相关规定和承诺，否则可能会导致保证金被扣除或者不予退还。此外，商家在申请退还保证金时，应确保所有订单已完成，且没有任何纠纷或投诉，以及已经清算了所有的账目，没有任何欠款。

由于政策和程序可能会有所变动，建议商家在准备退款时，直接咨询京东相关部门获取zui新的信息和指导。