京东大药房自营店入驻需要提交以下资料：

企业资质：包括企业营业执照、税务登记证、组织机构代码证等相关资质证明，确保企业合法经营。

药品经营许可证：如果销售药品，必须具备药品经营许可证，这是从事药品经营活动的必备证件。

药品GSP认证：GSP是药品经营质量管理规范的缩写，商家需要提供药品GSP认证证书的扫描件或复印件。

品牌授权书：如果经营品牌商品，需要提供品牌授权书，确保所售商品为。

法人身份证：提供法人的身份证件，用于身份验证。

银行开户许可证：提供企业的银行开户许可证，用于资金结算。

商品清单、图片和描述：提供详细的商品信息，包括商品清单、高清图片和准确的描述，以便京东大药房审核。

其他相关证明：根据具体情况，可能需要提供其他相关的证明文件，如医疗器械经营许可证、进口药品通关单等。

在准备这些资料时，商家应确保所有信息真实、准确、完整，并遵守京东大药房的规定和要求。同时，商家可能还需要根据京东大药房的要求，提供额外的资料或进行实地考察。