京东自营店服装类目的收费标准主要包括保证金、平台使用费和交易佣金。根据新的信息，服装类目的保证金为3万元人民币，平台使用费为500元/月，交易佣金为2%。此外，商家还可能需要支付仓储费用，这些费用根据实际存储空间的占用情况进行计算。

请注意，这些费用是根据新可用的搜索结果提供的，实际收费标准可能会根据京东的政策调整而有所变动。在准备入驻之前，建议直接联系京东官方或访问京东guanfangwangzhan获取准确和新的收费信息。