如果您的京东自营店铺入驻申请被拒绝，您可以采取以下步骤来应对：

详细了解驳回原因：仔细阅读京东提供的驳回通知，了解具体的问题所在。这是改进和重新申请的关键。

补充或修改资料：根据驳回的原因，补充或修改您的企业资质、品牌授权、产品资质等相关资料。

联系专业服务商：可以考虑联系专业的服务商，它们提供专业的咨询和指导，帮助商家准备和审核所有必要的文件，确保符合京东的要求。

优化品牌和产品信息：如果驳回是因为品牌或产品竞争力不足，可以优化品牌定位和产品信息，提升市场竞争力。

加强与京东的沟通：在专业服务商的协助下，与京东的招商团队建立更有效的沟通，提高入驻成功率。

重新提交申请：在准备和修改完毕后，按照京东的要求重新提交入驻申请。

请注意，如果您的店铺连续被拒绝，可能会面临一定的申请限制。例如，有些信息显示，如果第二次入驻失败，可能需要等待90天才能再次申请入驻。因此，在重新申请之前，务必确保所有问题都已得到妥善解决，并且所有提交的资料都是准确和完整的。同时，保持与京东的良好沟通，理解平台的具体要求和市场趋势，有助于提高入驻成功率。