入驻京东国际自营店的商家需要支付以下费用：

保证金：根据商家的经营规模和经营品类的不同而有所不同，保证金的金额一般在万元至0万元之间。

技术服务费：技术服务费通常是根据商家在平台上的销售额来计算的，比例在2%至5%之间。

交易服务费：交易服务费率为0.6%。

此外，根据新的信息，京东国际可能会有特定的优惠政策，例如对于新店可能免收保证金。具体的费用结构和金额可能会根据商家的具体情况和京东国际的新政策有所调整。因此，在准备入驻时，建议直接咨询京东官方获取准确和新的费用信息。