京东大药房入驻需要准备的材料包括：

营业执照：确保企业合法性和合规性。

药品经营许可证：根据药房类型，药品经营许可证编号应为B、C、D或DB开头。

商标（可选）：若无商标，可以使用药品经营许可证和门头照片代替。

法人身份证：提供正反面复印件。

开户许可证：企业银行账户的相关证明。

执业药师注册证：根据药房类型，单体药房需1名执业药师注册证，连锁药房需2名。

一般纳税人证（若为小规模纳税人则不需要）。 

请注意，入驻材料和要求可能会有变动，建议在准备材料前，直接咨询京东大药房的官方入驻要求或联系zhuan业的入驻服务机构以获取新信息。