注册日本公司需要准备以下材料：

公司名称：至少提供3个名称选项，一般以株式会社结尾，中文、日文、英文均可。 

注册资本：虽然理论上1日元也可以，但建议根据实际情况设定，如申请经营管理者签证，注册资本金需高于500万日元。 

公司注册地址：需要是日本的实际地址。 

公司章程：详细规定公司的组织结构、经营范围、股东权益等。 

股东和董事的身份证明：包括护照、居留证明等，如果股东或董事是公司，则需要提供公司注册证书、章程等公证认证文件。 

注册资本证明：如银行转账凭证、出资证明等。 

印章：包括公司印章、法人代表印章等，并需要进行公证。 

业务计划书和财务报表：根据具体情况而定。 

所有非日语文件可能需要翻译成日语并加盖公证章。在准备材料时，应确保信息的准确性和完整性，以便顺利完成公司注册流程。