企业在京东开设店铺的数量限制取决于店铺类型和品牌策略。根据新的信息，同一家公司可以开设多个店铺，但每个店铺必须有独立的营业执照和税务登记证，且每个店铺的经营范围和品类应该有所不同，不能完全重叠。

对于旗舰店，同一品牌在同一二级类目下只能开设1家旗舰店。专卖店的情况是，同一公司主体同一品牌在同一二级类目下只能开设1家专卖店。专营店的数量限制是，同一公司主体在同一二级类目下多只能开3家专营店。

此外，同一个执照在不同的品类下可以开设多家旗舰店，专营店和专卖店没有数量限制。需要注意的是，具体政策可能会有更新，建议在准备开设店铺时，直接咨询京东官方或查阅新的入驻指南以获取确切信息。