开设京东自营店的成本主要包括以下几个方面：

店铺入驻费用：京东对自营店的入驻费用相对较高，具体金额因商家规模、经营类目等因素而异，一般在数万元至数十万元之间。

运营成本：包括员工薪酬、办公场地租金、水电费等日常运营支出。商家需要根据自身规模和运营需求合理规划运营成本。

仓储物流费用：商家需要自行承担仓储和物流费用，包括租赁仓库、采购仓储设备、商品运输和配送费用。这些费用因商品种类、数量和销售量等因素而异。

营销推广费用：用于提升店铺曝光度和销售业绩，包括广告投放、促销活动、品牌建设等支出。商家可以根据自身需求和预算制定合适的营销推广策略。

京东自营店的运营难度主要体现在以下几个方面：

严格的入驻审核标准：京东对自营店的审核标准极为严格，要求商家具备一定的资质和实力，包括公司资质、商标注册证、产品质量证明等相关文件。

较高的入驻门槛：京东要求商家具备一定的规模和实力，以保证能够为消费者提供优质的商品和服务。这包括注册资本、员工人数和销售业绩等条件。

复杂的运营管理流程：商家需要与京东的采销部门进行沟通和协调，很多设置和活动策划都需要与采销部门共同完成。同时，商家还需要遵守京东的各项规定和政策，确保商品质量和服务水平符合京东的标准。

开设京东自营店需要一定的资金投入，并且面临较高的运营难度。商家在决定是否开设自营店时，应该仔细评估自身的经济实力和运营能力，并做好充分的准备。